O acervo é formado por coleções das mais diferentes tipologias, reunidas ao longo de uma vida por seu idealizador e cuja aquisição remete ao período de fundação do museu, ainda no município de Santa Cruz do Arari.
São exemplares de cerâmica arqueológica, material lítico, instrumental de caça e pesca, objetos de culto, numismática, indumentária, documentos históricos e meios de transporte, além de espécimes da fauna e flora local que, uma vez organizados, sintetizam a relação homem-natureza dentro do ecossistema marajoara.
Tratadas desde 2020 pelo Sistema Integrado de Museus, estas coleções que atualmente contabilizam cerca de 4.000 registros, deverão ser catalogadas e submetidas aos demais processos curatoriais, como a higienização e o devido acondicionamento, para que sejam, finalmente, disponibilizadas ao grande público com a reinauguração do museu.
